Süt Endüstrisinde Kullanılacak Biyoaktif Transglutaminaz Enziminin E. Coli’de Yüksek Verimle Üretimi (TAGEM)

Mikrobiyal Transglutaminaz enzimi ülkemizde her geçen gün kullanımı yaygınlaşan bir enzimdir. Transglutaminaz, süt ve et endüstrisinde gıdaların kıvamını ve katma değerini arttıran, raf ömrünü uzatan, protein yıpranmasını azaltan ve diğer gıda katkı maddelerinin kullanımının azalmasını tetikleyen bir enzimdir. Bu proje kapsamında firmamız Transglutaminaz enziminin üretimi için sentetik biyoloji yöntemleri kullanarak gen sentezi, rekombinant protein üretimi için prokaryotik klonlama, E. Coli’de protein üretimi, saflaştırma, enzim aktivasyonu, aktivite ölçümü ve doz belirleme çalışmaları yapmıştır. Proje sonunda E. Coli’de yüksek verimle Translutaminaz enzimi üretimi başarılmış ve üretilen enzimin aktivite ve ünite değerlerinin de ideal seviyede olduğu gösterilmiştir.

Biyofarmasötik Rekombinant İlaç Üretimi İçin Ortak Biyoteknoloji Laboratuvarı Kurulması (İşbirliği-Güçbirliği Desteği – KOSGEB)

  Bu proje sayesinde Türkiye’nin ilk devlet destekli sentetik biyoloji ortak laboratuvarı kurulmuş olup bu alanda faaliyet gösteren Sentebiolab liderliğinde 5 farklı şirket bu ortak laboratuvarın kurulumu için güçlerini birleştirerek bir ilke imza atmışlardır. 

Mültipl Miyelom Hastaları İçin Prognostik Gen Biyobelirteç Kiti Geliştirilmesi (TÜBİTAK-TEYDEB)

  Mültipl Miyelom kötü huylu plazma hücreleri tarafından gelişen ve ikinci en yaygın hematolojik kanserdir. Biyobelirteç kitler kanser hastalarında kemoterapik tedaviye başlamadan önce hastaların tedaviye cevabını önceden bilebilmekte ve tedavinin takip edilmesi, direnç gelişimi olduğu durumda tedavinin erkenden yön değiştirmesine olanak sağlamaktadır. Bu proje kapsamında geliştirilmiş olan biyobelirteç kit mültipl miyelom hücre hatlarında FDA tarafından onaylanmış kemoteröpatik ilaçlara karşı direnç profilleri belirlenmiştir. Daha sonra bu hücrelere direnç modeli oluşturularak mikroçip teknolojisi ile hücrelerin dirençli ve dirençli hale gelmeden önceki durumlarının gen ekspresyon profilleri belirlenmiştir. İstatistiksel analizlerle her hücre için dirençli/normal hücrelerin gen ekspresyon profilleri karşılaştırılmış ve dirençten sorumlu genler belirlenmiştir. Bu genler arasında 7 tanesinin hücre hatlarında ve klinik örneklerde doğrulaması başarıyla yapılarak belirlenen genler ile prototip gen biyobelirteç kit geliştirilmiştir.

Kuantum Dot (Q-Dot) Görüntüleme Cihazı (TÜBİTAK-TEYDEB)

  Bu proje ile Moleküler Biyoloji alanında çalışılan laboratuvarlarda çok sık ve rutin olarak yapılan bir deney olan Western blot için bir görüntüleme cihazı geliştirilmesi hedeflenmiştir. Bu cihazın sinyal üretimi için Q-Dot nanoparçacıklarının kullanıldığı Western blot deneylerinde sinyallerin görüntülenmesini sağlayabilmesi amaçlanmıştır. Ayrıca Q-Dot’lar ile konjuge ikincil antikorların da cihazla birlikte sunulmasıyla cihazın katma değerinin artması ve ürünün tam bir Western blot görüntüleme kitine dönüşmesi hedeflenmiştir. Proje kapsamında cihazın elde ettiği görüntüleri hatalardan arındıran bir yazılım ve protein array tarama sonuçlarını işleme ve değerlendirmede kullanılan iki yazılım da geliştirilmiştir. Tüm bu çalışmaların tamamlanmasıyla sistem Western blot ve Protein array taramalarının yapılabilmesine uygun, görüntüleme yapabilen ve bu görüntüleri işleyip sayısal değer oluşturabilen bir sisteme dönüşmüştür. Bu sayede proje başlangıcında hedeflenen tüm amaçlara ulaşılmıştır.

Kanser Tanısında Kullanılmak Üzere EGFR/Cen7 CASFISH Probu Geliştirilmesi (Ar-Ge İnovasyon-KOSGEB)

  Bu proje kapsamında meme, kolorektal ve akciğer kanserinin tanısında kullanılan ve ülkemizde yerli üretimi olmayan EGFR/Cen7 FISH probu geliştirilmesi hedeflenmiştir. Dünya Sağlık Örgütü’nün raporuna göre akciğer kanseri erkeklerde en yaygın kadınlarda ise ikinci en yaygın görülen kanser türüdür. Tüm dünyada yaklaşık 1,3 miyon kişinin ölümüne sebep olmaktadır. Kolorektal kanser de benzer şekilde hem erkeklerde hem de kadınlarda en yaygın olanlardan olup tüm kanserlerin %15’ini oluşturmaktadır. Sağlık Bakanlığı, ülkemizde yaklaşık 500.000 kanser vakası olduğunu bildirmektedir. Her yıl yaklaşık 150.000 kişi kanserden ölmektedir. Kanser vakalarında en önemli ölüm nedeni metastaz olmasıdır. Dolayısı ile erken tanı kanserle ilgili ölümleri azaltmak için son derece önemlidir. DNA probları kanserin erken teşhis edilebilmesi için son derece efektif yöntemlerdir. EGFR probları akciğer ve kolorektal kanserin tanısında kullanılan en yaygın prob çeşitlerindendir. Bu projede EGFR geni ile ilgili mutasyonların tanısında kullanılabilecek olan probların üretimi hedeflenmiştir. Prob üretiminde katı faz oligonükleotid sentezi yöntemi uygulanmaktadır. Dr. Oligo oligonükleotid sentez cihazı ile otomatik olarak katı faz oligonükleotid sentezi gerçekleştirilmekte ve teknik olarak kolon formatı kullanılmaktadır. Oligonükleotid sentez prosesi, fosforamidit monomerlerle tetrazol katalizine dayanır. Bu proje kapsamında firmamız prob üretimini gerçekleştirmiştir.

CRISPR Tabanlı Genom Düzenleme Kiti Geliştirilmesi (KOSGEB)